China: sin rastro de nuevas variantes covid-19 durante el reciente brote
Un nuevo análisis revela que todas pertenecen a cepas covid-19 existentes y conocida. Las variantes ómicron BA.5.2 y BF.7, entre las más dominantes.
No han surgido nuevas variantes de SARS-CoV-2 en China durante el reciente aumento de infecciones desde que el país terminó su política de Covid-19, según un análisis de casos en Pekín que se publica en The Lancet.
El análisis del genoma de 413 nuevas infecciones por covid-19 en esa ciudad que abarca el período de tiempo en que China levantó sus políticas de control de pandemias más estrictas sugiere que todas fueron causadas por cepas existentes.
El estudio sugiere que dos subvariantes existentes de ómicron, BA.5.2 y BF.7, entre las variantes más dominantes en Pekín durante 2022, representaron más del 90% de las infecciones locales entre el 14 de noviembre y el 20 de diciembre de 2022.
Los autores dicen que los resultados representan una instantánea de la pandemia en China, debido a las características de la población de Pekín y la circulación de cepas covid-19 altamente transmisibles allí.
Se informa ampliamente que China puso fin a su estrategia de cero Covid-19 el 7 de diciembre de 2022. Desde el levantamiento de estas estrictas políticas de control de la infección, que incluían confinamientos específicos, pruebas masivas y cuarentena, el aumento del número de casos ha generado preocupación de que puedan surgir nuevas variantes. En los tres años transcurridos desde que covid-19 fue declarado una pandemia global, la aparición de variantes como Alpha, Beta, Gamma, Delta y Ómicron ha causado múltiples oleadas de casos en todo el mundo.
Desde diciembre de 2019, los autores del estudio recolectaron rutinariamente muestras respiratorias de casos importados y locales de covid-19 en Pekín y seleccionaron muestras al azar para su análisis. No se habían reportado transmisiones locales persistentes en Beijing antes de diciembre de 2022.
En este último estudio, los autores analizaron muestras de covid-19 detectadas en Pekín en 2022. Las secuencias del genoma se generaron utilizando tecnología de secuenciación rápida y a gran escala, y su historia evolutiva y dinámica poblacional se analizaron utilizando secuencias covid-19 de alta calidad existentes.
De un total de 2.881 secuencias de alta calidad incluidas en el estudio, se seleccionaron y secuenciaron al azar 413 nuevas muestras entre el 14 de noviembre, cuando las infecciones comenzaron a aumentar bruscamente, y el 20 de diciembre de 2022. De estos, 350 fueron casos locales y 63 fueron importados. Los casos importados procedían de 63 países y regiones.
El análisis de las 413 nuevas secuencias reveló que todas pertenecen a cepas covid-19 existentes y conocidas. La cepa dominante en Pekín después del 14 de noviembre de 2022 fue BF.7, que representó el 75,7% de las infecciones locales. Otra subvariante de ómicron, BA5.2, fue responsable del 16,3% de los casos locales.
Las poblaciones de BA5.2 y BF.7 en la citada ciudad aumentaron después del 14 de noviembre de 2022. El tamaño efectivo de la población BA.5.2 no cambió sustancialmente entre el 14 y el 25 de noviembre de 2022, pero aumentó considerablemente alrededor del 30 de noviembre de 2022. El aumento coincidió con un mayor número de infecciones por BA.5.2 alrededor del 30 de noviembre de 2022. La población de BF.7 aumentó gradualmente a partir del 14 de noviembre de 2022.
George Gao, autor principal del estudio, del Instituto de Microbiología de la Academia de Ciencias de China, considera que dado el impacto que las variantes han tenido en el curso de la pandemia, era importante investigar si surgieron nuevas tras los recientes cambios en las políticas de prevención y control de covid-19 en China.
"Nuestro análisis sugiere que dos subvariantes conocidas de ómicron, en lugar de cualquier variante nueva, han sido las principales responsables del aumento actual en Pekín, y probablemente en China en su conjunto. Sin embargo, con la circulación continua a gran escala de la infección en China, es importante que continuemos monitoreando la situación de cerca para que cualquier nueva variante que pueda surgir se encuentre lo antes posible".
Los autores reconocen algunas limitaciones de su estudio. Si bien solo se analizaron los datos en Pekín en 2022, en lugar de la parte continental de China, los autores dicen que los datos son representativos del país en su conjunto. El número de casos de covid-19 confirmados por laboratorio en diciembre de 2022 no estaba disponible porque las pruebas obligatorias a gran escala terminaron, lo que sugiere que el verdadero número de infecciones está subestimado, lo que lleva a un grado de sesgo de muestreo en el conjunto de datos.
Se requiere más muestreo para estudiar la transmisibilidad y patogenicidad de las subvariantes de ómicron. Se asumió que la tasa evolutiva del virus era constante durante la etapa inicial del brote, aunque es posible que esto pueda variar dependiendo de la variante.
